早课：
早课是全寺僧众于每日清晨（约在寅丑之间）齐集大殿，念诵《楞严咒》、《大悲咒》、“十小咒”、《心经》各一遍，在念诵的起止都配有梵呗赞偈。其中，《楞严咒》为一堂功课，《大悲咒》、“十小咒”等为一堂功课，有些寺院这两堂功课轮流念，只有在佛教节日才念两堂功课。
如果在初一、十五，早课之前加唱“香赞”，即《宝鼎赞》：“宝鼎热名香，普遍十方，虔诚奉献法中王。端为世界祝和平，地久天长。端为世界祝和平，地久天长。南无香云盖菩萨摩诃萨，南无香云盖菩萨摩诃萨，南天香云盖菩萨摩诃萨。”如果在佛菩萨圣诞或普佛时，则唱《戒定真香》。
一般寺院在平时都是直接从《楞严咒》开始。《楞严咒》又称为《大佛顶如来顶髻白盖陀罗尼》，出自《大佛顶首楞严经》第七卷。在藏文经典中称为《大白伞盖总持陀罗尼经》，西藏各喇嘛寺院也是每日念诵的。经中说，十方诸佛以此神咒而成无上正觉，诵持此咒有降魔息灾、拔济群苦、制伏外道的作用。《楞严咒》的.咒文较长，有427句，2620字，其本身就构成为一堂功课。宋元以来一直盛行，特别是南宋和元两代，丛林每年于安居结夏中定有三月（农历四月十三至七月十三为期的楞严会制），节日、祝愿、祈祷、荐亡等无不讽诵。
念完咒语后，便念诵《心经》。然后，维那起腔唱：“摩诃般若波罗蜜多”三遍，再唱赞偈：“上来现前清净众，讽诵楞严秘密咒，回向三宝众龙天，守护伽蓝诸圣众。三途八难俱离苦，四恩三有尽沾恩，国界安宁兵革销，风调雨顺民安乐。大众熏修希胜进，十地顿超无难事，三门清净绝非虞，众等归依增福慧。阿弥陀佛身金色，相好光明无等伦，白毫宛转五须弥，绀目澄清四大海。光中化佛无数亿，化菩萨众亦无边，四十八愿度众生，九品咸令登彼岸。南无西方极乐世界，大慈大悲阿弥陀佛。”
两序大众出班绕佛，念“南无阿弥陀佛”几百声。接着，转板念“阿弥陀佛”，大众归位，跪下三称“南无观世音菩萨、南无大势至菩萨、南无清净大海众菩萨”。
然后，维那起腔念《普贤菩萨十大愿王》，悦众敲引磬和板：“一者礼敬诸佛，二者称赞如来，三者广修供养，四者忏悔业障，五者随喜功德，六者请，七者请佛住世，八者常随佛学，九者恒顺众生，十者普皆回向。十方三世一切佛，一切菩萨摩诃萨，摩诃般若波罗蜜。”
接着，维那起腔念：“四生九有，同登华藏玄门；八难三途，共入毗卢性海（接铃鼓）”。大众站起来，维那起腔唱三归依。接着，如果逢朔望，加念“南无香云盖菩萨摩诃萨”三称。维那起腔，大众跟着木鱼声念“南无护法韦陀尊天菩萨”三称。然后，换成敲引磬，念《大吉祥天女咒》。最后，唱《韦驮赞》：“韦驮天将，菩萨化身，拥护佛法誓弘深。宝杵镇魔军，功德难伦，祈祷副群心。南无普眼菩萨摩诃萨，摩诃般若波罗蜜。”
如果逢初一、十五朔望的时候，早课完后，顶礼三拜，不问讯，仍然向上立定，维那师鸣磬三声，独自称各位祖师名字。顶礼完后，仍然站立，维那敲磬三声，然后维那呼：“时维佛历XX年，公元XX年XX月XX日朔（望）旦良辰，大众师云集大殿普礼三拜”。维那敲三下磬，接三下大钟。这样，早课全部结束。
晚课：
晚殿有三堂功课，就是诵《佛说阿弥陀经》和念佛名；礼拜八十八佛和诵《大忏悔文》；放蒙山施食。诵《阿弥陀经》和念佛名是祈愿自己往生净土。
八十八佛中，前五十三佛名出自《观药王药上二菩萨经》，是娑婆世界的过去佛；三十五佛名出自《决定毗尼经》，是十方世界的佛。八十八佛都可以为众生作忏悔主，因此向八十八佛申述自己改悔罪恶的愿望，是可以灭罪的。
《大忏悔文》也出于《决定毗尼经》，唐不空三藏曾译有《三十五佛名礼忏文》，可见在印度也是日常遵行的。最后一句“南无法界藏身阿弥陀佛”则是依据《焰口经》而增入，合为八十九佛名。
本来，诵念佛号时，要求配以礼拜的动作，一佛一拜，再加以礼佛开始前的诵偈和发愿文时所行的礼拜，及后来念诵《大忏悔文》时所行的礼拜，总共合成一百零八拜，表示愿断一百零八烦恼的意思。
一百零八礼的礼法是：初四句、金刚上师、归依佛法僧三句、“我今发心”至“三菩提”、尽虚空一切诸佛、一切尊法、一切贤圣僧各一礼，如来十号一礼，八十九佛八十九礼，“如是等”至“今皆忏悔”、“今诸佛世尊”至“我今归命礼”、所有十方世界中八旬、于一尘中尘数佛八句、以诸最胜妙华曼十二句、我昔所造诸恶业四句、十方一切诸众生四句、十方所有世间灯四句、诸佛若欲示涅槃四句、所有礼赞供养福四句、愿将以此胜功德十六句各一礼，合满其数。
我国古人虽把忏悔文定为一百零八礼，但是实际除了个人如法礼诵以外，在丛林里多是跪诵而不礼拜。
八十八佛后，大众问讯转身对面而立，进行蒙山施食。蒙山施食仪是宋代外国甘露法师（或是不动）所作，他居住在四川雅安的蒙山，他依据《救拔焰口饿鬼经》以及《水陆施食法》，并且以“威德光明如来咒”及“甘露咒”为主，集中各种密教的咒语，成为《施食仪》。在施食时，先准备一杯净水及一些米。行者（放蒙山者）作一定的观想，口中念诵一定的咒语，双手作一定的手势，三密相应，才能成就施食。
放完蒙山后，维那起腔，唱：
“四生登于宝地（行者向上礼拜），三有托化莲池（行者向左拜，大众问讯以答），河沙饿鬼证三贤（向者向上拜），万类有情登十地（行者向右拜，大众问讯以答）。
阿弥陀佛身金色（行者向上拜），相好光明无等伦，白毫宛转五须弥（至班首前一拜，问讯，往回走），绀目澄清四大海。光中化佛无数亿（在中间原来的位置向上一拜），化菩萨众亦无边，四十八愿度众生（至维那前一拜），九品咸令登彼岸。
南无西方极乐世界大慈大悲阿弥陀佛（行者至方丈前一拜，若无方丈，向上三拜，问讯，归位）。”
接着，用引磐跪白“十方三世佛”等《大慈菩萨发愿偈》或宋代遵式大师所作“一心归命”等《小净土文》。然后，念“是日已过，命亦随减，如少水鱼，斯有何乐？大众当勤精进，如救头然，但念无常，慎勿放逸！”，前半句偈是‘警策大众偈’，是《出曜经》中叙述佛陀因见三条大鱼被惊涛浸灌，流入浅水，各自争脱厄难的情景而说的偈子；后半句偈是“普贤警众偈”，是警策行人应当奋勇前进，不可稍有松懈。
此二偈合在一起，很早就被丛林念诵仪中采用，北宋《禅苑清规》卷二《念诵》条中便录有此文，以后各种清规和念诵集也多收录。
然后，三归依，念《大悲咒》，唱《伽蓝赞》：“伽蓝主者，合寺威灵，钦承佛敕共输诚。拥护法王城，为翰为屏，梵刹永安宁。南无护法藏菩萨摩诃萨，摩诃般若波罗蜜。”
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