1、白芥子：种子近球形，直径2～2.5mm。表面淡黄色，光滑，在放大镜下观察，可见细微的网纹，一端具一圆形淡褐色的种脐。去掉种皮可见2肥厚子叶，油质、相互纵向摺叠，胚根包藏于其间。气微，味辛辣。以粒大，饱满，色黄白，纯净者为佳。
2、黄芥子：种子形状与白芥子相似而较小，直径1.2～1.8mm，表面鲜黄色至黄棕色，少数为暗红棕色。气微，味极辛辣。以子粒饱满，均匀，鲜黄色，无杂质者为佳。
3、白芥子种子横切面：最外为1列切向延长的表皮黏液细胞，其外壁向外特化成黏液层;下皮1~2列细胞，壁薄;栅状细胞1列，其内壁和侧壁的1/2处增厚，外壁菲薄;色素细胞呈颓废状。内胚乳为1列类方形或长方形的细胞，内含糊粉粒，其下方为颓废细胞层。子叶发达，细胞内含糊粉粒和油滴。
4、黄芥子种子横切面：表皮细胞1列，切向延长;下皮细胞1列，细胞近方形或径向延长，宽约20微米，其内壁和侧壁均增厚，外壁菲薄;紧靠栅状细胞层为色素层。内胚乳为1列长方形细胞，内含糊粉粒，其下为颓废细胞层。子叶和胚根细胞中含脂肪油滴和糊粉粒。
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