1、从形态上来说
南方红豆杉是常绿乔木，曼地亚红豆杉是常绿灌木，相比之下，曼地亚红豆杉的高度一般较低，但是要是作为盆栽种植的话，高度上的区别就可以忽略了。因为在室内观赏，都不会选择太高的树苗。
2、从对于环境的适应能力来说
杂交品种显然对环境的适应性更强，虽然曼地亚红豆杉的生长速度稍慢于南方红豆杉，但是相比之下，南方红豆杉对于环境的要求还是略高一些。
3、从内部紫杉醇的含量来说
我想这一点应该是内在上区别最大的一点，曼地亚红豆杉当中的紫杉醇含量是所有红豆杉品种当中最高的一种，在它的枝叶、根部、种子上都能够提取到，其含量比南方红豆杉高十倍左右。
4、从抗寒性来说
南方和曼地亚红豆杉都抗寒，能够生活在零下十几多度的低温环境下，但是曼地亚红豆杉在零下二十多度也能够生存，并且没有任何损伤，耐低温的性能更强。
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