1、穴居蝙蝠的主要天敌主要有蛇类,蜥蜴等；树栖型（一些果蝠）的天敌还有一些猛禽和猫科动物.蝙蝠还有的天敌就是人类,如关岛大蝙蝠就是因为当地人的捕食而灭绝的。
2、蝙蝠的体温变幅很大，可达56℃（由-7.5-48.5℃），某些大型的食果蝠，由于其生理和行为特点不同，体温比较恒定，而绝大多数的小型食虫蝠则是典型的异温动物。据观察，生活在温带的蝙蝠，一生中其不活动的时间比活动的时间要多得多，夏天它们差不多整个白天和夜间的一部分时间都在睡眠，有些种类当天气寒冷的时候，便像鸟类一样进行长距离的季节性迁徒，到南方去过冬，留在原地的种类则在严寒的冬季便进入长时期的冬眠。据不完全统计，栖息在列宁格勒附近的大耳蝠和北棕蝠在一生中其活动的时间仅占1/15~1/20，其余的时间都在睡眠（库加金，1959）。当环境温度达到16~28℃时，蝙蝠即处于深睡状态，睡眠的蝙蝠生理机能减慢，新陈代谢降低。由于代谢低耗，致使某些蝙蝠寿命较长。
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