1、首先从植物学分类上来说，藤椒属于芸香科多年生灌木，又名竹叶花椒、万花针、白总管、竹叶总管等。而花椒属于芸香科、花椒属落叶小乔木，属类不同，但都属芸香科。也就是说藤椒和花椒在植物学分类上来说，藤椒和花椒是不同属的，藤椒是多年生灌木而花椒却是小乔木。从枝茎来说，藤椒属于小乔木，植株高度比花椒稍矮，枝叶较为紧凑、细小，枝干刺多，枝干延长形状像藤蔓，故得名藤椒。而花椒树非常高大，一般达5米左右，有的可能更高一些，这与生存的环境相关，树干常有不规则的分枝，嫩枝颜色绿色常有红色的伴随，老枝干为深灰褐色，枝干上有十分坚硬的刺。从花朵来说，藤椒花与花椒花都生于枝条的顶端，花椒的数量比较多大约有20-30片，呈绿色，花期在4-5月左右。
2、其次从果实来说，藤椒的果实幼时为绿色，有微凸起少数油点，果色为绿色，有光泽，含油多，结籽是像葡萄一样呈串状，果期8-10月左右，依种植地气候土壤等因素有所不同。而花椒的果实在生长期颜色会发生变化，幼时为青绿色，成熟期为紫红色，8-10月结果。而且藤椒在树上结的籽是像葡萄一样一串一串的，而花椒在树上结的籽是一攥一攥的。
3、从味道上来说，藤椒幼时即可以食用，这一点与花椒不同，藤椒的香味比花椒清香，假如把花椒没有成熟的放在嘴里，口感特别苦涩，但是藤椒就没有这种苦涩味，并且幼时藤椒还是主要的辅料。
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